初始具备两艘工程舰（Worker），其作用是采集资源、修理船只以及抢救伤船。不过现在处于未升级状态，所以只能去采矿（选中后按H键）。在原有的三艘护卫舰（Acolyte）之外继续建造护卫舰，然后赶往出事地点援救盟友的截击机（Intercetor）。注意这里人口是有限制的，所以要留好工程舰和侦察机的位置。中间会有几架战斗机攻击工程舰，使用护卫舰可以轻松摆平。另一处敌人和盟军也在开火，去帮忙可以，不去也无所谓。因为交战双方都是一些驱逐舰（Destoyer）和离子炮舰（Ion Connon Frigate）之类的大型舰只。随后母舰会告诉你发现敌人讯号，造一艘侦察机（Recon）前往探测，结果发现是帝国的矿船在采矿。干掉他们并研究连接技术就可以建造ACV这种两艘护卫舰连接在一起的玩意了。这关纯粹是上手关，没有什么难的。只不过要记住任务完成之后最好把资源全采集干净，因为如果是最简单难度的游戏钱是不愁的，但是高难度下钱就紧张了。不过和原作相比，这里的资源供应并不是很短缺。

　　　　Otskirt of Hiigara System
　　一开始母舰将废弃舱抛射，随后制造工程舱（Engineering Module）。一俟工程舱建造完毕就可以研究工程舰的修理和抢救能力了。这时探测器发现三个不同的信号源，并怀疑其中一个是失散了的盟友Bushan-Re的。如果上一关的侦察机还在的话，用它去探测信号源。虽然任务要求是使用导航点轮流探测，但其实只要侦察机接近中间那个就会发现身受重伤的Bushan-Re。把工程舱飞到它旁边，点击工程舰按Crtl-R，或者使用右键弹出菜单选择修理选项。这里需要注意的是工程舰只能一个一个地点，而且要靠近Bushan-Re，否则你只会看到这些愚蠢的家伙试图修理身边完好无损的同伴。修理过程非常漫长，用\键把游戏提高到八倍速会比较好一点。不过在短兵相接的时候如果你没有十成十的把握，使用这个加速键将会因为无暇微操作而使你全军覆没。修理一段时间之后母舰会发现超空间跳跃信号，几艘非敌对的支援舰会赶来。不过不要高兴太早，因为这些是奇袭者的伪装，所以尽可能造多一点ACV放在Bushan-Re身边保护。把这些敌人干掉之后会发现旁边有废弃舱的信号。派工程舰去捡，途中要注意突袭者前来抢夺，所以把大部队全部用来保护工程舰比较好，至于Bushan-Re现在有能力保护自己，用一个工程舰继续修理就行了。拿回来以后可以研究全息投影技术，这是制造拟态舰（Mimic）和MCV的必要技术。拟态舰可以变成敌舰或者小行星，只要对方没有探测器就无法发现。其攻击形式是自杀攻击，而组合之后的MCV则能给予两倍的伤害，并且同样具有迷惑功能。把所有奇袭者消灭之后即可过关。

　　　　Corus-Tel System
　　这一关的任务是要寻找Clee-San。首先研究补燃器，可以使撞击舰（Ramming Frigate）推动大型舰只。这样不但对敌人造成伤害，还可以起到分散敌人强火力的作用。等待一会母舰指示发现敌情，往雷达标示的地方飞就能发现Clee-San。然而敌人的布雷舰布下了感应雷，需要用拟态舰前去引爆――当然如果让普通舰只英勇献身也可以――但必须要有一艘拟态舰到Clee-San的身边。之后部队要保护Clee-San返航，而敌人在路上设下重重埋伏。于是母舰决定制造武器舱（Weapon Module）并随后研究导弹发射器，升级之后的护卫舰可以在补给之后携带两枚导弹。一路上需要小心的就是两颗感应雷，清除之后Clee-San返航，所有人进行超空间跳跃到下一关。由于目前为止还没有什么大型舰只的出现，所以使用机动能力高的护卫舰将是战略首选。日后一段时间里护卫舰和变形成ACV切换的战术将十分犀利，所以不要觉得好玩就按I键卖掉护卫舰造撞击舰玩。个人认为一段时间之内撞击舰实在是没有什么作为。

　　　　Deep Space(Tei Sector)
　　当舰桥传输动力给研究舱时，灾难发生了。下层甲板整个都被炸飞了出去，母舰机舱（Hangar Module）完全损毁，我们不得不重新花钱再造一个。用10艘护卫舰掩护Clee-San，去看看下层甲板的情况――注意！一定要10艘，否则保证你哭都来不及。Clee-San带着10艘护卫舰来到了还有活动迹象的下层甲板旁边，正想要进行资料传输。这时一阵粒子流击中了所有的飞船，母舰立刻和Clee-San及其护卫队失去了联络。为了弄清到底发生了什么事情，母舰开始进行感染源研究。很显然这是一种病毒性自主生物Beast，一种前所未见的异性，任何靠近它的单位都将受到感染并和原来的同胞反目。因为现在那10艘护卫舰正疯狂地向母舰攻击（知道为什么一开始不能多派部队进行保护了吧！），于是母舰决定任何人不得靠近Clee-San的飞船，但是一群通过超空间跳跃追踪而来的奇袭者发现了Clee-San。他们认为这艘研究舰可以让他们更好地跟踪Hiigara人。于是这群蠢货也无一幸免地被粒子流击中了。更糟糕的是他们带来的都是一些离子炮舰之类的强火力。无奈之下母舰只好放弃小型飞船，进行紧急跳跃。

　　　　Aiowa System
　　劫后余生的母舰来到了Aiowa星系，在这里他们发现Bentusi商队的信号。这些中立者曾经在家园原作中出现，以500多RU的高价乘玩家被围攻之势强卖离子炮舰技术。现在我们需要派一艘侦察机前去和他们联系。找到Bentusi人的时候发现他们正在被Beast攻击，而其兵力正是上一关那些被感染的奇袭者部队……Hiigara人的善意警告并没有被孤傲的Bentusi人听进去，他们认为自己三门激光炮足以应付任何来犯之敌。这个时候Caal-Shto通过超空间跳跃也赶来支援我们了。但是他似乎并不了解Beast的可怕，所以我们不但要保护Bentusi母舰，还要保护Caal-Shto。这时突然出现的重型巡洋舰（Heavy Cruiser）击毁了Bentusi的母舰，大爆炸把四周的飞船炸了个精光。如果你兵力雄厚，可以在重型巡洋舰赶到之前先干掉它。但是Bentusi母舰的阵亡不会带来任务的失败，目前当务之急是要保护好Caal-Shto，因为爆炸也影响到了它，船上的系统大部分失灵，而生命维持系统也只剩下30%。这时建议使用两到三架撞击舰和护卫舰的导弹对付重型巡洋舰，当然29架护卫舰的导弹齐射一下子就能干掉这家伙。之后母舰工程师将会研究补给系统，研究完成之后我们就可以在母舰上建造高级工程舱和12个补给舱。这样做的好处是可以研究微型飞船以及增加人口上限。保护Caal-Shto一段时间不受敌人骚扰就可以进入下一关。

　　　　Kadliir Nebula
　　新型的微型飞船是守卫舰（Sentinel）。它的作用是互相合作造成一堵防护力场，大量以球形阵形排布的守卫舰可以组成一颗球形防护罩，常常用来保护重要的大型舰船。在这一关里就十分有用。
　　首先我们发现前方存在帝国的信号，使用侦察机前去侦察。一看之下真是不得了：N多的离子炮舰围绕在航母（Carrier）和研究中心旁。而如果你让一队前来侦察的战斗机发现Caal-Shto并顺利返航向总部报告的话，那么这些密密麻麻的宇宙战舰就会想马蜂一般向你涌来。所以最好把护航部队派遣在Caal-Shto的前侧翼进行保护，防止任何敌人接近。在此之前先在母舰里制造装甲舱，这样就能在研究中心把部队护盾生到第一级。接下来要做的就是派遣一艘侦察机做先锋，沿着NAV Point一路前行。在这条直线上敌人的布雷舰布下了密集的感应雷，最后还有一艘重型巡洋舰和一些小型舰只堵在路上。为了能够顺利护送Caal-Shto离开Nebula，研究中心开发出了定向遥控技术，这一项目完成后就可以制造吸血鬼（Leech），一种可以附着在敌方战舰上进行腐蚀或者窃取工程舰采集到的资源的小东西。另外研究中心决定开发护卫舰引擎，这样我们就能依靠更为强大的蜂巢舰消灭敌人。只要不惊扰帝国舰队，敲掉那艘重型巡洋舰让Caal-Shto通过虫洞门安全地离开，所有飞船就可以通过超空间跳跃离开并进入下一关。

　　　Otskirt of Kadliir Nebula
　　这一关任务很简单，但是做起来非常难。Caal-Shto终于修复了大部分的动力，和我们分道扬镳了。在这里我们接受到了一个信号，侦察机返回的信息表明Taiidan共和国的殖民飞船正受到Beast巡航导弹的袭击，所有被击中的飞船都会为Beast所感染，而殖民飞船则会变本加厉地发射自己的巡航导弹继续感染其他人。一旦所有的殖民飞船都成为Beast的部队，任务也就告失败。导弹的攻击是一波波的，每一次都会从三个不同的方向向目标袭击，为了应付这个局面，工程师开发了EMP的研究项目。如此一来ACV就成为非常有用的部队了。一般的战术是使用护卫舰的高机动性打击巡航导弹，而在对付大型舰艇时两两合并组合成ACV。大队的ACV使用起EMP来将造成大面积的电磁泼，使得所有敌人舰只行动不能，随后再分成护卫舰进行导弹齐射。这样一来很快就能掩护所有的殖民飞船离开。另外一开始就能在研究所里把装甲升到第二级，对飞船的耐久不无裨益；而量子炸弹则可以提高拟态舰和MCV的爆炸威力，研究一下没有坏处。把所有Beast和被感染的部队摧毁即可过关。

　　　　Deep Space(Koreth's Rift Sector)
　　战斗即将来临，为此我们必须抓紧时间搞生产、勤采矿，备战备荒。不久一艘战列舰向我们发出求救信号。这是一艘间谍船，他有重要的信息告诉我们，但是同时我们必须先把在他身后紧追不舍的帝国舰队消灭，用大量ACV可以轻松搞定。然而随之而来的消息不容乐观，仅仅是帝国的防御部队就能把我们全部消灭。为了打击敌方经济、搞垮帝国后勤，母舰决定使用工程舰俘获三艘敌方资源舰，以及任意一艘驱逐舰级飞船。这里需要注意的不仅仅不能放走任何一艘敌舰回去报信，而且俘获敌人不单要把对方的耐久度降到50%以下，还要注意自己是否具有足够的人口空间。俘获舰只之后可以研究的科技取决于舰只的类型。俘获离子炮舰可以研究超级离子炮并制造激光战列舰；而俘获攻击舰（Asslut Frigate）则可以研究能量武器等等。

　　　　 Close Orbit,Gozan Ⅳ
　　我们俘获的资源舰现在作为运输船飞往联络点准备下载资料。在此期间工程师研究并开发了工程舰的水晶收集能力以及部队的二级护盾。运输船一到达目的地我们就发现在不远处敌人布下了8×10的探测器列阵，而我们所要做的就是摧毁其中一个好让传输部队不为敌人所发现。当运输舰到达基地星球外围它们就不受你控制了，这时我们必须保护好自己的母舰，因为敌人的离子炮舰和攻击舰将分拨对母舰进行疯狂的进攻。另外在基地星球也有战列舰和不少离子炮舰等着运输船，更糟糕的是他们还有用做修理的支援舰。这个时候使用ACV的EMP能力再分成护卫舰进行导弹攻击是最佳的选择。只要运输船能够成功返航我们就可以进行超空间跳跃了。不过最好在此之前多采集一些资源，以及制造一些大型舰只补充被回收的运输船的人口空缺。

　　　　Debris Field(Koreth's Rift Sector)
　　侦察机214在这个地区发现了被废弃的围攻炮，虽然它已经破烂不堪了，但是我们相信工程师一定能够好好利用这个曾经威力无比的武器。用四个工程舰去抢救围攻炮，把所有的兵力用来保护这四艘脆弱的飞船，因为显然想要捡这个垃圾的人不止我们。如果围攻炮被奇袭者抢走了则一定要夺过来，否则任务便告失败。这里需要注意的就是不要盲目使用加速键，否则东西给人家抢走来不及拿回来可有的哭了！这里敌人非常阴险，居然把自己伪装成废墟的样子攻击工程舰，所以不管敌人攻势如何，一定要保护好四艘工程舰。返航的路上由于奇袭者具备了隐形能力，所以随时随地要小心敌人激光舰的攻击。当然如果你有本事也可以抢一艘隐形飞船回去研究其技能。当然应付这种情况最好的方法就是研究超级探测器，之后所有的飞船都能发现隐形单位、拟态舰以及吸血鬼了。俘获围攻炮之后立刻进行研究，在此期间敌人会招来一艘航母发动疯狂的进攻，全力保护母舰，研究完毕后第一时间制造围攻炮。不一会母舰会收到超空间跳跃的信号，原来是Caal-Shto带着援军赶到了。但这并不是什么好事情，因为几乎同一时间Beast的母舰在它身后出现了。虽然Caal-Shto被感染的局面已经无可挽回了，但是我们还是决定使用围攻炮做一次尝试。但是非常不幸，长时间的准备似乎并不成熟，围攻炮的攻击没有起到预想的作用。而Beast还想得寸进尺地在得到Caal-Shto之后继续感染我们。万不得已，母舰只好做出超空间跳跃的指令，所有人向下一星系进发。

　　　　 System AZ-23769
　　一来到这个混乱的地方我们就收到了Faal-Corum的信号。不幸的是从我们的跳跃位置和时间以及Faal-Corum所受的攻击来看，谁都会以为是我们袭击了这些可怜的人。为了表示我们的立场，无论他们如何对待我们，我们都不能还击。终于Faal-Corum为这场误会向我们道歉，而我们也以修理Faal-Corum母舰作为我们诚信的保证。一段时间之后，母舰认为我们需要增强实力，于是修理机器和驱逐舰引擎出现在研究选项中，今后我们的大型战舰就能自动修复了。而航母和驱逐舰的建造更是让我们如虎添翼。作为可以增加人口上限的航母，我们还额外制造了它自带的补给舱。至于驱逐舰，在一段时间之内10艘这样的家伙将会所向披靡。但是在此之前我们必须解决手头的麻烦――Beast通过超空间跳跃也来到了这里。我们非常难过，因为这艘被感染的航母正是Caal-Shto，而我们不得不消灭它。把所有的敌人干掉并确保Faal-Corum安然无恙之后，它和我们互相祝福了一番，就跳跃走了。而我们在接受了Faal-Corum的一位宇航员之后，怀着在寂寞宇宙中难得的感动，也得离开这里。

　　　　Turanic Outpost(Kyori Sector)
　　拟态舰663向我们报告，奇袭者的Turanic基地看起来象是Beast下一个目标。为了不让宇宙变成修罗场，我们努力和Turanic基地联系并一再表明我们的和平立场。然而他们却不做任何回复，甚至派遣了军队攻打我们。好吧，既然这些家伙这么任性，那么我们就要用11艘驱逐舰打到他们投降为止。使用八倍速一路挺进，这不是什么难事。即使是航母在11艘驱逐舰的强力攻势下也无所作为。正当它们配备的两门激光炮和四门能量炮超敌人前哨基地招呼过去的时候，帝国的攻击舰群突然出现了，母舰认为他们是奇袭者招来的援军。不管怎样我们都会把奇袭者先解决掉。但是事情一下子有了转机：帝国军团居然什么也没有干就走了！真叫人不敢相信！无奈之下前哨基地只好投降，关闭一且武器防御并准许我们登陆。

　　　　Location Unkouwn
　　很糟糕，我们来到了一个未知的区域。母舰的各个功能舱都损坏得不成样子，幸好驱逐舰具备自己的超空间跳跃引擎，否则我们就不仅仅是无法弹射工程舰那么简单了。这无疑是敌人的一个陷阱，因为现在他们的驱逐舰又从不同方向向我们袭来。母舰要求将它们用撞击舰撞开――谁管那一套！让他们尝尝11艘驱逐舰列阵攻击的滋味！第一波攻击来自三个方向，各有两艘驱逐舰。采用各个击破的方式消灭他们之后弹射舱终于修好了，谢天谢地，乘这一关目前还没有资源可以采集，立刻对母舰进行抢修，随时准备第二波攻击，研究超级驱逐舰引擎，好让我们使用可怕的无畏舰（Dreadnought）虽说驱逐舰列阵的确披荆斩棘，然而我们还是要感谢Faal-Corum及其大票援军的到来。多好的盟友！现在让我们把他们都干掉！在Faal-Corum的工程舰的努力下，我们的建造能力也恢复了。赶紧制造机舱替代损害的那个，帮助Faal-Corum的军队消灭任何胆敢拦在我们面前的敌人。在超空间跳跃舱修理完毕后立刻离开这个鬼地方！